ARIF, Izro Raihan (2021) Virtual Skrining Senyawa Turunan Flavonoid dari Genus Artocarpus sebagai Inhibitor VEGFR-2. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Download (310kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Download (323kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (444kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (587kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (736kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (599kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (405kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Download (860kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Izro Raihan Arif-I1C017056-Skripsi-2021.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)

Abstract

Vascular Endothelial Growth Factor 2 (VEGFR-2) merupakan reseptor tirosin kinase yang berperan dalam angiogenesis. Pada beberapa kasus kanker ditemukan adanya overekspresi dari VEGFR-2. Agen penghambat VEGFR-2 memiliki potensi sebagai anti-angiogenesis yang diketahui memiliki potensi dalam menangani kanker. Senyawa flavonoid dilaporkan memiliki potensi sebagai penghambat tirosin kinase. Pada penelitian ini dilakukan untuk mencari senyawa turunan flavonoid dari genus Artocarpus yang memiliki potensi sebagai penghambat VEGFR-2. Penelitian ini dilakukan secara virtual skrining dengan metode penambatan molekul pada target protein VEGFR-2 (PDB ID: 4AG8) dengan menggunakan kontrol axitinib. Preparasi dilakukan dengan memisahkan ligan dari reseptor dan menghilangkan molekul air. Validasi dilakukan dengan menambatkan ligan pada reseptor untuk menghitung nilai RMSD dan menentukan koordinat penambatan. Penambatan senyawa uji dilakukan menggunakan koordinat dari hasil validasi. Visualisasi untuk melihat ikatan antara senyawa uji dan reseptor. Nilai RMSD sebesar 0,893 Å. Senyawa kanzonol C (ACP 51) memiliki energi ikatan terendah -10,6 kkal/mol, sedangkan energy ikatan pada kontrol (obat axitinib) sebesar -8,4 kkal/mol. Hasil visualisasi kanzanol C menunjukkan ikatan hidrogen pada Cys1045 dan Asp1046, interaksi hidrofobik meliputi pi-sigma Leu840, Lys868, Val916; alkil Leu889, Val899; pi-alkil Val848, Ala866, Leu1035, Phe1047. Senyawa kanzonol C (ACP 51) secara in silico merupakan hasil yang terbaik sebagai inhibitor VEGFR-2, dengan nilai energi terendah dibandingkan senyawa flavonoid lainnya.

Actions (login required)

View Item