APRILIA, Vika (2022) Studi Potensi Senyawa Aktif Dari Bahan Alam Sebagai Inhibitor Kinase Insert Domain Receptor Secara In Silico. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Download (110kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only Download (715kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Download (125kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only until 30 August 2023. Download (133kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only until 30 August 2023. Download (383kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only until 30 August 2023. Download (236kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only Download (583kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Download (52kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Download (141kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Vika Aprilia-I1C018017-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only Download (751kB)

Abstract

Latar Belakang: KDR/VEGFR-2 memainkan peran penting dalam angiogenesis pada kanker payudara. Senyawa aktif bahan alam dilaporkan memiliki aktivitas sitotoksik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui senyawa aktif dari bahan alam yang paling berpotensi sebagai inhibitor KDR/VEGFR-2 berdasarkan hasil penambatan molekuler dan aturan Lipinski, sehingga dapat dikembangkan sebagai kandidat obat baru. Metodologi: Penelitian ini dilakukan dengan lima tahap meliputi preparasi protein dan ligan menggunakan Autodock Tools dalam format pdb dan pdbqt, validasi metode dengan menambatkan kembali protein dan ligan natif menggunakan Autodock Vina dan dihitung nilai RMSD menggunakan Pymol, penambatan molekul senyawa aktif bahan alam dan kontrol terhadap protein untuk mendapatkan energi ikatan dan visualisasi hasil menggunakan BIOVIA Discovery Studio untuk melihat jenis interaksi yang terjadi. Selanjutnya uji aturan Lipinski dilakukan menggunakan SCFBio. Hasil Penelitian: Kurkumin menghasilkan nilai energi ikatan terendah sebesar -9,9 kkal/mol, sementara kontrol sunitinib sebesar -9,4 kkal/mol. Pada visualisasi penambatan, terjadi interaksi hidrogen dan interaksi hidrofobik pada kurkumin dengan melibatkan asam amino Cys919 dan Asp1046 yang merupakan sisi aktif dari KDR/VEGFR-2. Kurkumin memenuhi 5 syarat aturan Lipinski dengan berat molekul 368 Da, 2 ikatan hidrogen donor, 6 ikatan hidrogen akseptor, molar refractivity sebesar 102,016 dan nilai logP sebesar 3,369. Kesimpulan: Kurkumin berpotensi sebagai inhibitor KDR/VEGFR-2 dan memiliki prediksi sifat fisikokimia yang baik serta berpotensi untuk dikembangkan sebagai senyawa inhibitor KDR oral.

Actions (login required)

View Item