AULIA, Nadia Sayyidah (2023) Efek Penambatan Senyawa Demetoksikurkumin dan Bisdemetoksikurkumin terhadap Protein LSD1. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Download (245kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (696kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Download (223kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (267kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (391kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (351kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (351kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Download (196kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Download (532kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Nadia Sayyidah Aulia-I1C017047-Skripsi-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (690kB)

Abstract

Beta-talasemia merupakan penyakit genetik pada sintesis hemoglobin di dalam sel darah merah yang ditandai dengan menurunnya produksi β-globin. Senyawa kurkumin diketahui dapat meningkatkan kadar HbF pada sel K562. Senyawa demetoksikurkumin dan bisdemetoksikurkumin diketahui memiliki stabilitas dan bioavaibilitas yang lebih baik dari kurkumin. Penelitian ini bertujuan untuk melihat interaksi senyawa demetoksikurkumin dan bisdemetoksikurkumin pada protein LSD1 secara in silico. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental yang dilakukan dalam dua tahap. Pertama, validasi metode yang meliputi pengunduhan struktur LSD1 (PDB ID: 6KGP), preparasi struktur protein dengan menghilangkan molekul air dan memisahkan molekul protein dan ligan natif, penambatan kembali dengan Ligan natif menggunakan AutoDock Vina dan penghitungan nilai RMSD. Kedua, penambatan molekuler senyawa demetoksikurkumin dan bisdemetoksikurkumin dengan protein LSD1 menggunakan koordinat hasil validasi yang valid dan visualisasi penambatan dengan menggunakan BIOVIA Discovery Studio 2020. Validasi menunjukkan nilai RMSD yaitu 1,402 Å. Diperoleh energi ikatan terendah untuk protein LSD1 yaitu -10,4 kkal/mol untuk senyawa demetoksikurkumin dan -10,2 kkal/mol untuk senyawa bisdemetoksikurkumin. Residu asam amino pada LSD1 yang berperan pada pengikatan senyawa uji demetoksikurkumin yaitu Thr624; Val288 dan Arg316. Residu asam amino pada LSD1 yang berperan pada pengikatan senyawa uji demetoksikurkumin yaitu Thr624; Leu659; Val811; Arg316; Leu625; Tyr761 dan Trp751. Senyawa demetoksikurkumin menunjukkan hasil yang lebih baik dan interaksi yang lebih potensial pada protein LSD1 dibandingkan bisdemetoksikurkumin.

Actions (login required)

View Item