FARIDAH, Nur (2024) DNA Barcoding Famili Strigidae Berdasarkan Gen Mitokondria Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) dan Cytochrome B (Cyt b). Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Download (607kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (830kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Download (259kB)
	PDF (BabI) BAB I-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Restricted to Repository staff only until 25 January 2025. Download (259kB)
	PDF (BabII) BAB II-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Restricted to Repository staff only until 25 January 2025. Download (263kB)
	PDF (BabIII) BAB III-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Restricted to Repository staff only until 25 January 2025. Download (462kB)
	PDF (BabIV) BAB IV-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabV) BAB V-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Download (227kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Download (559kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Nur Faridah-B1A019044-Skripsi-2024.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (293kB)

Abstract

Strigidae merupakan salah satu famili Ordo Strigiformes yang terus mengalami perubahan taksonomi. Hal ini terjadi akibat adanya revisi taksonomi dan penemuan spesies baru. Perubahan ini dapat berdampak pada sulitnyamanajemen konservasi burung hantu. Identifikasi berdasarkan karakter morfologipada burung hantu sulit dilakukan karena variasi morfologi antar spesies sangatrendah. Oleh karena itu, identifikasi burung hantu secara molekuler perludilakukan. Aplikasi DNA barcoding sebagai alat identifikasi hewanmemanfaatkan sekuen spesifik DNA mitokondria. Penelitian ini menggunakan sekuen penanda MtDNA Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) dan Cytochromeb (Cytb). Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman taksonomikspesies burung hantu pada Famili Strigidae menggunakan teknik DNA barcoding. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Genetika, Pusat Riset Biosistematika dan Evolusi, BRIN selama 10 bulan. Metode penelitian yang digunakan adalah metode kuantitatif untuk menghitung jarak genetik intraspesifik dan inter-spesifik serta mengetahui konstruksi filogenetik burung hantu famili Strigidae berdasarkan sekuen nukleotida DNA mitokondria Cytb dan COI.Penelitian ini bermanfaat sebagai acuan penentu upaya konservasi genetik yangefektif dalam manajemen konservasi burung melalui barcode DNA dengan genpenanda Cytb dan COI. Variabel bebas penelitian ini adalah barcode penandaDNA mitokondria COI dan Cytb. Variabel terikat penelitian ini keragamanspesies dan hubungan kekerabatan anggota Famili Strigidae. Parameter penelitianyang akan dihitung adalah jarak genetik intraspesies, interspesies anggota FamiliStrigidae. Jarak genetik dan konstruksi filogenetik famili Strigidae dianalisismenggunakan software MEGA 11. Berdasarkan hasil penelitian hanya terdapat 7 sampel yang dapat digunakanuntuk konstruksi filogenetik. Hal ini diduga disebabkan oleh kualitas DNA danhasil sekuening yang buruk dilihat dari kromatogram yang memiliki peak rendah,overlapping dan noise background lebih dari 20%. Faktor yang dapatmempengaruhi hasil ini antara lain kualitas.Terbentuknya multiple band dansmear yang menunjukkan DNA terfragmentasi. Sampel AG 7305, AG 788, dan AG 1796 terkonfirmasi sebagai spesies Otus angelinae, Ketupa ketupu, dan Ketupa ketupu berdasarkan hasil BLAST dengan nilai similaritas 99,60%, 98,76%, dan 98,74%, query cover 96%, 100%, dan 100%, serta e-value untuk ketiga sampel tersebut sebesar 0,0. Sampel AG 706, 743, 713, dan 777 memilikinilai similaritas dibawah 97%. Terdapat inkonsistensi percabangan O. lempiji danO. angelinae pada konstruksi filogenetik Cytb dan COI dengan jarak genetik padaCytb sebesar 10% dan COI sebesar 0,2%. Berdasarkan konstruksi filogenetik CytbO. angelinae dan O. lettia monofiletik dengan nilai jarak genetik 3,6% sedangkan pada COI O. angelinae monofiletik dengan O. lempiji serta memiliki nilai jarak genetik sebesar 0,2%. Genus Bubo berkerabat dekat dengan genus Ketupa.

Actions (login required)

View Item