ELIZA, Etik (2024) Perbandingan Genetik Beberapa Kultivar Tanaman Tapak Dara [Catharanthus roseus (L.) G. Don] Berdasarkan Daerah Intergenik atpB-rbcL. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Download (66kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (166kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Download (71kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 16 February 2025. Download (69kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 16 February 2025. Download (72kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 16 February 2025. Download (155kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (261kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Download (64kB)
	PDF (Daftar Pustaka) DAFTAR PUSTAKA-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Download (144kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Etik Eliza-B1A020107-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (329kB)

Abstract

Tapak dara [Catharanthus roseus (L.) G. Don] merupakan tanaman hias dan tanaman obat dari Familia Apocynaceae. Tanaman yang banyak ditemukan di daerah tropis dan subtropis ini memiliki beberapa kultivar dengan berbagai variasi morfologi, terutama dalam hal warna bunga. Seleksi kultivar tapak dara, khususnya terkait dengan pemanfaatannya sebagai tanaman obat, memerlukan landasan karakterisasi molekuler. Hal ini karena selain tidak dipengaruhi oleh faktor lingkungan, karakterisasi molekuler dapat dilakukan pada semua fase pertumbuhan dan perkembangan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan perbandingan genetik beberapa kultivar C. roseus berdasarkan sekuen daerah intergenik atau intergenic spacer (IGS) atpB-rbcL dan menganalisis hubungan filogenetik di antara kultivar-kultivar tersebut. Penelitian dilakukan dengan metode eksplorasi dengan pengambilan sampel tanaman C. roseus secara acak dari Kota Purwokerto dan sekitarnya. Kultivar C. roseus yang digunakan merupakan tipe liar dan mutan. Variabel dependen berupa kultivar C. roseus, sedangkan variabel independennya adalah perbedaan genetik di antara kultivar-kultivar tersebut dengan parameter berupa persentase atau jumlah situs polimorfik, baik substitusi basa maupun indel. Analisis molekuler dilaksanakan di Laboratorium Genetika dan Molekuler Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman, yang meliputi tahapan ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB dan amplifikasi IGS atpB-rbcL menggunakan teknik PCR dengan sepasang primer universal. Sekuensing IGS atpB-rbcL dilaksanakan dengan mengirimkan produk PCR ke Firstbase Malaysia. Data sekuen yang didapatkan diolah menggunakan perangkat lunak Bioedit versi 7.0.4.1 dan diperiksa secara manual. Verifikasi sekuen dilakukan melalui blasting menggunakan referensi pangkalan data NCBI. Penjajaran sekuen dilakukan menggunakan Program ClustalW di dalam perangkat lunak BioEdit versi 7.0.4.1. Analisis hubungan filogenetik antarkultivar dilakukan menggunakan analisis Neighbor-Joining, UPGMA, dan Maximum Likelihood dalam perangkat lunak MEGA versi 11. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sekuen IGS atpB-rbcL yang didapatkan menunjukkan perbedaan, baik antara kultivar C. roseus liar dan kultivar mutan maupun di antara sesama kultivar tipe liar. Perbedaan terlihat baik berupa substitusi basa maupun insersi-delesi. Meskipun demikian, hubungan kekerabatan genetik antarkultivar tersebut masih relatif berdekatan.

Actions (login required)

View Item