WIBOWO, Rafif Dzaky (2024) Identifikasi Gen Resistensi Antibiotik yang Terkait dengan Paparan Residu Antibiotik pada Sungai Banjaran Kabupaten Banyumas dengan Analisis Metagenomik. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.
![[img]](http://repository.unsoed.ac.id/style/images/fileicons/other.png) |
PDF (Cover)
COVER-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Download (149kB) |
|
PDF (Legalitas)
LEGALITAS-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Download (466kB) |
|
PDF (Abstrak)
ABSTRAK-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Download (270kB) |
|
PDF (BabI)
BAB-I-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (234kB) |
|
PDF (BabII)
BAB-II-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (293kB) |
|
PDF (BabIII)
BAB-III-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (382kB) |
|
PDF (BabIV)
BAB-IV-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (357kB) |
|
PDF (BabV)
BAB-V-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Download (218kB) |
|
PDF (DaftarPustaka)
DAFTAR PUSTAKA-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Download (274kB) |
|
PDF (Lampiran)
LAMPIRAN-Rafif Dzaky Wibowo-G1A020059-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB) |
Abstract
Latar belakang: Penggunaan antibiotik di sektor kesehatan dan agraris dapat menghasilkan limbah residu antibiotik yang mencemari lingkungan sungai. Residu antibiotik pada lingkungan dapat menyebabkan timbulnya gen resistensi antibiotik akibat terjadinya antibiotic-induced mutagenesis pada bakteri. Tujuan: Mengidentifikasi gen resistensi antibiotik yang terkait dengan paparan residu antibiotik pada air yang mengalir di bagian hulu, tengah, dan hilir Sungai Banjaran. Metode: Penelitian ini merupakan penelitian in silico dengan pendekatan komputasional dengan sampel air dari Sungai Banjaran yang diambil pada bagian hulu, tengah, dan hilir. Sampel air akan dilakukan ekstraksi DNA menggunakan kit Quick-DNA™ MagBead Plus Kit untuk memperoleh DNA murni. Hasil ekstraksi DNA kemudian disekuensing menggunakan shotgun metagenomic sequencing untuk mendapatkan sekuens DNA. Sekuens DNA selanjutnya dianalisis menggunakan Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center 3.33.16 yang di didalamnya terdapat algoritma Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) untuk mengidentifikasi gen resistensi antibiotik. Hasil: Hasil analisis pada bagian hulu ditemukan 101 gen resistensi dengan 76 gen resistensi intrinsik, 22 gen melalui Horizontal Gene Transfer (HGT), dan 3 gen hasil mutasi. Sampel dari bagian tengah teridentifikasi 83 gen resistensi dengan 38 gen intrinsik, 35 gen melalui HGT, 4 gen mutasi, serta 6 gen yang terkait dengan paparan residu antibiotik. Sampel dari bagian hilir ditemukan 40 gen resistensi dengan 19 gen intrinsik, 18 gen HGT, 2 gen mutasi, dan 1 gen yang terkait dengan paparan residu antibiotik. Kesimpulan: Terdapat 6 gen yang terkait dengan paparan residu antibiotik phosphonic, kloramfenikol, dan fluorokuinolon pada sampel air dari bagian tengah sungai, serta 1 gen yang terkait dengan paparan residu antibiotik tetrasiklin pada sampel dari bagian hilir sungai.
| Item Type: | Thesis (Skripsi) |
|---|---|
| Nomor Inventaris: | G24107 |
| Uncontrolled Keywords: | Analisis metagenomik, gen resisten antibiotik, pencemaran residu antibiotik, Sungai Banjaran |
| Subjects: | A > A366 Antibiotics |
| Divisions: | Fakultas Kedokteran > S1 Pendidikan Dokter |
| Depositing User: | Mr Rafif Dzaky Wibowo |
| Date Deposited: | 22 Jul 2024 07:48 |
| Last Modified: | 22 Jul 2024 07:48 |
| URI: | http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/27973 |
Actions (login required)
 |
View Item |