PURNAMASARI, Nur Atin (2020) Analisis Molekuler 16S rRNA Bakteri Rizosfer Tanaman Singkong (Manihot esculenta) Potensial PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) dan Bioassay pada Beberapa Varietas Padi Gogo. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (cover) 1. COVER-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Download (321kB)
	PDF (legalitas) 2. LEGALITAS-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (279kB)
	PDF (abstrak) 3. ABSTRAK-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Download (159kB)
	PDF (BabI) 4. BAB-I-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Restricted to Repository staff only until 7 October 2025. Download (163kB)
	PDF (babII) 5. BAB-II-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Restricted to Repository staff only until 7 October 2025. Download (194kB)
	PDF (babIII) 6. BAB-III-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Restricted to Repository staff only until 7 October 2025. Download (470kB)
	PDF (babIV) 7. BAB-IV-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (734kB)
	PDF (babV) 8. BAB-V-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Download (117kB)
	PDF (daftarpustaka) 9. DAFTAR PUSTAKA-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Download (233kB)
	PDF (lampiran) 10. LAMPIRAN-Nur Atin Purnamasari-A1D016141-SKRIPSI-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Padi (Oryza sativa L.) merupakan salah satu tanaman pangan pokok masyarakat Indonesia. Kebutuhan beras dipasok dari padi sawah sekitar 95% dan padi gogo dari lahan kering hanya 5%. Produktivitas padi gogo masih rendah dibandingkan padi sawah, yaitu hanya 3,342 ton/hektar. Pemanfaatan lahan kering salah satunya lahan Ultisol yang luas di Indonesia, yaitu sekitar 45.794.000 Ha perlu dilakukan untuk meningkatkan jumlah produksi tanaman padi. Namun demikian, tanah Ultisol memiliki kendala, yang salah satunya adalah kandungan hara yang rendah. Salah satu upaya untuk mengatasi kendala tersebut adalah dengan pemupukan yang ramah lingkungan dan berkelanjutan. Pemupukan yang ramah lingkungan dan berkelanjutan salah satunya dengan penggunaan mikroorganisme PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria). Tujuan dari penelitian ini adalah: 1) menentukan identitas isolat bakteri TG-4 dan SR-2 hasil isolasi dari rizosfer tanaman singkong Desa Tanggeran dan Srowot, Banyumas melalui analisis bioinformatika sekuen 16S rRNA, 2) mengetahui hubungan kekerabatan dari isolat bakteri TG-4 dan SR-2 dengan bakteri lainnya yang telah terdata di GenBank, 3) untuk mengetahui kemampuan isolat bakteri TG-4 dan SR2 dalam menghasilkan hormon IAA (Indole Acetic Acid), dan 4) menentukan isolat bakteri yang terbaik pengaruhnya terhadap pertumbuhan beberapa varietas padi lahan kering dalam skala laboratorium. Penelitian ini dilakukan dengan beberapa tahapan, yaitu identifikasi molekuler dengan metode sekuensing gen 16S rRNA, pengujian IAA secara kualitatif, dan bioassay. Urutan nukleotida hasil sekuensing disejajarkan dengan sekuen dari GenBank menggunakan BLAST-N di website NCBI untuk mengetahui kemiripan antara isolat bakteri dengan strain referensi di GenBank. Hasil BLAST-N digunakan dalam membuat pohon filogenetik dengan menggunakan program MEGA X. Pengujian isolat bakteri penghasil IAA dilakukan dengan mengkultur isolat ke dalam media Nutrient Broth (NB) yang telah disuplementasi dengan L-triptofan 1000 ppm dan ditambahkan reagen salkowski. Bioassay dilakukan dengan perendaman benih padi gogo varietas INPAGO UNSOED 1 (V1), INPAGO UNSOED Parimas (V2), dan INPAGO 8 (V3) dengan isolat bakteri B0 (kontrol), B1 (isolat TG-4), B2 (isolat SR-2), dan B3(isolat TG-4 & SR-2) dan ditanam di dalam jar berisi tanah Ultisol steril. Hasil dari analisis sekuensing gen 16S rRNA diperoleh bahwa urutan basa nukleotida isolat SR-2 berukuran 1398 bp dan TG-4 berukuran 1401 bp. Setelah dianalisis menggunakan BLAST-N, hasil menunjukkan bahwa isolat SR-2 memiliki homologi 100% dengan Bacillus paramycoides strain MCCC 1A04098 16S ribosomal RNA partial sequence dan isolat TG-4 memiliki homologi 98,77% dengan Bacillus albus strain MCCC 1A02146 16S ribosomal RNA partial sequence. Hasil analisis filogenetik pada program MEGA X menunjukkan bahwa isolat SR-2 dengan Bacillus paramycoides berkerabat dekat dengan jarak genetiknya, yaitu 0.000. Isolat TG-4 berkerabat dekat dengan Bacillus albus dengan jarak genetik 0.000. Hasil pengujian isolat bakteri TG-4 dan SR-2 dalam menghasilkan IAA menunjukkan bahwa kedua isolat mampu menghasilkan IAA. Hasil analisis bioassay menggunakan uji F dengan taraf kesalahan 5% menunjukkan tidak adanya interaksi nyata antara perlakuan varietas dengan pemberian bakteri. Berdasarkan uji lanjut DMRT diperoleh bahwa perlakuan B3 (isolat TG-4 & SR-2) memberikan pengaruh lebih tinggi terhadap pertumbuhan padi gogo.

Actions (login required)

View Item