NUGRAHA, Dafa Garin (2025) Keragaman Genetik Padi Hitam Aksesi Lokal Menggunakan Marka Simple Sequence Repeat (SSR) dan Indel (Insertion Deletion). Masters thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Download (205kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (664kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Download (171kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 5 February 2026. Download (237kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 5 February 2026. Download (240kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 5 February 2026. Download (385kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (691kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Download (165kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Download (256kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Dafa Garin Nugraha-A2A023001-Tesis-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (419kB)

Abstract

Padi hitam merupakan salah satu jenis padi yang kaya antioksidan karena memiliki kandungan antosianin yang cukup tinggi. Jenis padi ini memiliki keragaman yang lebih sedikit jika dibandingkan dengan padi putih pada umumnya. Keragaman genetik yang sedikit ini dipengaruhi oleh pola budidaya yang turun temurun dan mengakibatkan erosi genepool. Oleh karena itu, perlu adanya analisis keragaman padi hitam pada tingkat gen, serta upaya peningkatan keragaman genetik melalui iradiasi gamma. Penelitian dilaksanakan di screenhouse dan Laboratorium Pemuliaan Tanaman & Bioteknologi Fakultas Pertanian Unsoed pada bulan Januari sampai dengan Oktober 2024. Materi penelitian berupa populasi padi hitam lokal non mutan yang diambil dari berbagai wilayah di Pulau Jawa, dan populasi padi mutan terpilih. Penelitian dilaksanakan menguji keragaman genetik 9 jenis padi hitam lokal dan empat jenis padi mutan hasil iradiasi gamma. Data hasil penelitian dianalisis menggunakan software NTSYS untuk mengetahui keragaman genetik berdasarkan kemunculan pita DNA hasil amplifikasinya Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat lima jenis marka polimorfik dan satu marka monomorfik, yaitu TreB. Marka polimorfik tersebut dapat mendeteksi keragaman tingkat DNA pada sampel padi hitam aksesi lokal non mutan dengan menunjukkan polimorfisme pada hasil PCR berdasarkan skoring pita DNA yang muncul pada ukuran tertentu. Namun, marka R8M33 tidak dapat mendeteksi keragaman genetik padi hitam mutan dikarenakan terjadinya kerusakan DNA akibat proses iradiasi gamma dan rendahnya kualitas DNA genomik yang dihasilkan untuk proses PCR. Hal ini menyebabkan susunan basa nitrogen berubah dan menyebabkan primer dan susunan DNA sampel padi mutan tidak komplemen, sehingga menyebabkan hasil amplifikasi DNA yang sangat buram dan berada di bawah DNA ladder. Katakunci: antosianin, marka molekuler, padi hitam

Actions (login required)

View Item