Tingkat Ekspresi Gen Spesifik Pada Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Rentan Dan Moderat Tahan Terhadap Ganoderma boninense

RAHARTI, Vivi Restu (2019) Tingkat Ekspresi Gen Spesifik Pada Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Rentan Dan Moderat Tahan Terhadap Ganoderma boninense. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

[img]
Preview
PDF (Cover)
COVER-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-2019.pdf

Download (22kB) | Preview
[img] PDF (Legalitas)
LEGALITAS-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (304kB)
[img]
Preview
PDF (Abstrak)
ABSTRAK-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-2019.pdf

Download (93kB) | Preview
[img] PDF (BabI)
BAB-I-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (92kB)
[img] PDF (BabII)
BAB-II-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (152kB)
[img] PDF (BabIII)
BAB-III-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (194kB)
[img] PDF (BabIV)
BAB-IV-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (694kB)
[img] PDF (BabV)
BAB-V-Vivi Restu Raharti-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (84kB)
[img] PDF (Daftarpustaka)
DAFTAR PUSTAKA-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (173kB)
[img] PDF (Lampiran)
LAMPIRAN-Vivi Restu Raharti-A1D015110-Skripsi-FAPERTA-2019.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (392kB)

Abstract

Kelapa sawit merupakan salah satu komoditas perkebunan yang strategis di Indonesia. Tahun 2016, produksi minyak sawit menurun sebesar 0,16% dari tahun sebelumnya. Salah satu faktor penting yang menyebabkan penurunan hasil adalah penyakit busuk pangkal batang (BPB) yang mengakibatkan kerugian besar pada produksi tandan buah segar yang dikarenakan berkurangnya jumlah tanaman kelapa sawit di perkebunan. Penyakit ini disebabkan oleh Ganoderma boninense yang menginfeksi akar tanaman kelapa sawit. Saat ini, cendawan tersebut tidak hanya menyerang pertanaman kelapa sawit yang tua tetapi juga yang muda, sehingga semakin berbahaya untuk perkebunan kelapa sawit. Pendekatan bioteknologi modern seperti analisis ekspresi gen yang terkait G. boninense digunakan untuk mempelajari mekanisme molekuler dari respon tanaman terhadap infeksi patogen, pengaruh biologis dan biosintesis hormon. Gen yang terkait dengan mekanisme molekuler tersebut, yaitu MDIS1-interacting receptor like kinase 1-like (MIK1), Wall-associated receptor kinase 5-like (WAKL5), Cytosolic sulfotransferase 12-like isoform XI (SOT12), 1aminocycloporane-1-carboxylate oxidase (ACO1), dan Glutathione S-transferase U19-like (GSTU19). Metode Real-Time quantitative Polymerase Chain Reaction (RT-qPCR) digunakan untuk studi ekspresi gen karena memiliki kepekaan yang tinggi, efisien dan reliable. Metode ini digunakan untuk memperkirakan tingkat transkrip gen (mRNA). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat ekspresi gen putatif spesifik pada tanaman kelapa sawit hasil persilangan yang diduga rentan dan moderat tahan terhadap G. boninense. Dua genotipe tanaman kelapa sawit rentan dan satu genotipe tanaman kelapa sawit moderat tahan terhadap G. boninense dari hasil persilangan dilakukan pengujian kuantitatif menggunakan lima primer yang mengkode gen putatif yang diduga berhubungan dengan penyakit busuk pangkal batang. Gen putatif tersebut, yaitu EgMIK1, EgWAKL5, EgSOT12, EgACO1, dan EgGSTU19. Gen housekeeping EgActin digunakan sebagai gen referensi pada kontrol internal proses real-time qPCR. Variabel yang diamati terdiri atas amplification plot, melting curve, ekspresi basal dan nilai rasio ekspresi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lima gen putatif diregulasi secara berbeda antara genotipe tanaman kelapa sawit A09, 23 dan 27. Ekspresi gen putatif dibandingkan antara genotipe tanaman kelapa sawit yang rentan (A09 dan 23) dan moderat tahan (27). Tiga gen putatif up-regulated EgACO1, EgSOT12 dan EgWAKL5 pada akar dapat dipertimbangkan sebagai biomarker positif yang potensial untuk tanaman kelapa sawit yang rentan. Hasil menunjukkan perbedaan regulasi molekuler antara tanaman kelapa sawit yang rentan dan moderat tahan terhadap G. boninense.

Item Type: Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris: A19102
Uncontrolled Keywords: Kelapa sawit, Ganoderma boninense, real-time qPCR, ekspresi gen
Subjects: C > C519 Coffee industry
Divisions: Fakultas Pertanian > S1 Agroteknologi
Depositing User: Mr Supriyana Supriyana
Date Deposited: 19 Feb 2020 02:39
Last Modified: 19 Feb 2020 02:39
URI: http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/3754

Actions (login required)

View Item View Item