YUDHIESTIRA, Luqman (2025) Keragaman Genetik Pagrus major (Temminck dan Schlegel, 1843) dari Selatan Pulau Jawa Menggunakan Metode Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Download (144kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (686kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Download (226kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Restricted to Repository staff only until 27 November 2026. Download (266kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Restricted to Repository staff only until 27 November 2026. Download (268kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Restricted to Repository staff only until 27 November 2026. Download (480kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (834kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Download (262kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Download (258kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Luqman Yudhiestira-B1A021110-Skripsi-2025.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (706kB)

Abstract

Pagrus major (Temminck & Schlegel, 1843) atau red seabream merupakan spesies ikan dari Family Sparidae yang umumnya ditemukan di perairan Jepang dan Korea. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman lokus, gen, polimorfisme dan juga struktur populasi P. major menggunakan metode Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Dilatarbelakangi oleh pentingnya keragaman genetik sebagai dasar adaptasi dan ketahanan populasi, catatan awal P. major di perairan Indonesia menjadikan studi keragaman genetik ini penting untuk dilakukan. Penelitian dilaksanakan antara bulan Agustus hingga Oktober 2025 di Laboratorium Genetika Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman. Bagian tubuh ikan yang digunakan adalah sirip yang kemudian diekstraksi DNA-nya menggunakan kit Zymo Research. Amplifikasi DNA dilakukan dengan PCR-RAPD menggunakan primer OPA 01, OPA 02, OPA 04, OPA 07, dan OPA 10. Produk PCR kemudian divisualisasi melalui elektroforesis gel agarosa dan dianalisis berdasarkan pola pita DNA. Parameter yang diamati mencakup keragaman lokus, keragaman gen, polimorfisme serta struktur populasi dengan bantuan software Arlequin. Hasil analisis keragaman genetik menunjukkan bahwa tingkat polimorfisme mencapai 100%, menandakan adanya variasi genetik tinggi antar individu P. major di Laut Selatan Jawa. Keragaman gen sebesar 0,9964 dimana hampir semua individu memiliki kombinasi pita DNA berbeda, mencerminkan heterozigositas tinggi. Adapun keragaman lokus sebesar 0,396394 termasuk dalam kategori tinggi, menunjukkan bahwa sekitar 39,6% posisi nukleotida berbeda antar individu, sehingga populasi ini memiliki variasi genetik yang luas dan penting bagi keberlanjutan populasi. Analisis AMOVA memperlihatkan 26,70% variasi antar subpopulasi dan 73,30% variasi dalam populasi, dengan FST = 0,26701 (P < 0,001) yang mengindikasikan diferensiasi genetik sedang hingga tinggi berupa struktur populasi yang nyata serta terbatasnya aliran gen antar subpopulasi (Nm = 0,686). Perbedaan kondisi geografis dan oseanografi di pesisir selatan Jawa diduga berperan dalam membentuk pola struktur genetik tersebut.

Actions (login required)

View Item