Profil RAPD Beberapa Isolat Ganoderma spp. di Kabupaten Banyumas

YULIA, Ana (2017) Profil RAPD Beberapa Isolat Ganoderma spp. di Kabupaten Banyumas. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

[img] PDF (COVER)
Cover_1.pdf
Restricted to Registered users only

Download (17kB)
[img] PDF (LEGALITAS)
Daftar isi dan kelengkapan_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (683kB)
[img] PDF (ABSTRAK)
Abstrak_1.pdf
Restricted to Registered users only

Download (95kB)
[img] PDF (BABI)
Bab I_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (208kB)
[img] PDF (BABII)
Bab II_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (218kB)
[img] PDF (BABIII)
Bab III_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (221kB)
[img] PDF (BABIV)
Bab IV_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (940kB)
[img] PDF (BABV)
Bab V_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (86kB)
[img]
Preview
PDF (DAFTARPUSTAKA)
Daftar Pustaka_1.pdf

Download (335kB) | Preview
[img] PDF (LAMPIRAN)
Lampiran_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (1MB)

Abstract

Ganoderma spp. merupakan jamur terbawa tanah yang dapat merugikan dan juga menguntungkan bagi manusia. Penyebaran jamur ini sangat luas, termasuk di Kabupaten Banyumas, Jawa Tengah. Hasil penelitian terdahulu menunjukkan bahwa terdapat 43 tubuh buah yang ditemukan di wilayah ini dengan sebaran dari dataran rendah hingga sedang. Karakterisasi secara morfologi perlu didukung dengan kajian molekuler untuk mendapatkan data identifikasi, klasifikasi, dan kekerabatan yang lebih akurat. Salah satu marka yang dapat digunakan dalam kajian molekuler adalah Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Tujuan penelitian ini adalah untuk (1) mengetahui profil RAPD beberapa isolat Ganoderma spp. di Kabupaten Banyumas dan (2) mengetahui hubungan kekerabatan genetik antarisolat Ganoderma spp. di Kabupaten Banyumas berdasarkan marka RAPD. Metode yang digunakan adalah survai dengan teknik pengambilan sampel secara acak (random sampling). Sampel Ganoderma spp. yang diperoleh diidentifikasi karakter makromorfologi dan mikromorfologinya, serta dipelajari keanekaragaman genetiknya dengan prosedur kerja yang terdiri atas (1) isolasi DNA genomik, (2) penghitungan konsentrasi dan kemurnian DNA genomik, serta (3) amplifikasi marka RAPD menggunakan teknik PCR dengan empat primer acak, yaitu OPC-1, OPC-2, OPC-4, dan OPC-5. Analisis polimorfisme dilakukan secara deskriptif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa keempat primer yang digunakan menghasilkan pita polimorfik dengan polimorfisme 100%. Tingkat kemiripan genetik berkisar antara 0,48 dan 0,82. Dendogram yang disusun menunjukkan bahwa pada koefisien 63% isolat Ganoderma spp. mengelompok menjadi tiga klaster, yaitu klaster I dengan tujuh isolat (Gano-1, Gano-2, Gano-3, Gano-4, Gano-7, Gano-8, dan Gano-10), klaster II dengan dua isolat (Gano-5 dan Gano-9), serta klaster III dengan satu isolat (Gano-6). Hubungan kekerabatan paling dekat ditemukan antara Gano-7 dan Gano-10 dengan koefisien similaritas sebesar 82%, sedangkan hubungan kekerabatan paling jauh ditemukan antara Gano-4 dan Gano-9, antara Gano-5 dan Gano-6, serta antara Gano-6 dan Gano-8 dengan koefisien similaritas 42%. Berdasarkan analisis bootstrap, diketahui bahwa kelompok-kelompok sampel Ganoderma spp. memiliki tingkat kepercayaan rendah (<50%). Klaster yang terbentuk menunjukkan bahwa isolat-isolat yang teridentifikasi tidak mengelompok berdasarkan wilayah geografis dan substrat tumbuh.

Item Type: Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris: B17043
Uncontrolled Keywords: isolat, Ganoderma spp., RAPD, Banyumas
Subjects: F > F427 Fungi
Divisions: Fakultas Biologi > S1 Biologi
Depositing User: Mr Fathu Rahman Rosyidi
Date Deposited: 25 Jun 2020 04:38
Last Modified: 25 Jun 2020 04:38
URI: http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/4350

Actions (login required)

View Item View Item

Downloads

Downloads per month over past year