Analisis Hubungan Kekerabatan Beberapa Aksesi Duku (Lansium Domesticum) Lokal Banyumas, Banjarnegara, dan Purbalingga Menggunakan Marka RAPD

PUTRI, Andita Eka (2017) Analisis Hubungan Kekerabatan Beberapa Aksesi Duku (Lansium Domesticum) Lokal Banyumas, Banjarnegara, dan Purbalingga Menggunakan Marka RAPD. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

[img]
Preview
PDF (Cover)
Cover_1.pdf

Download (112kB) | Preview
[img] PDF (Legalitas)
Legalitas dan bagian awal TA_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (455kB)
[img]
Preview
PDF (Abstrak)
Abstrak_1.pdf

Download (93kB) | Preview
[img] PDF (BabI)
Bab.I_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (157kB)
[img] PDF (BabII)
Bab.II_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (242kB)
[img] PDF (BabII)
Bab.II_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (242kB)
[img] PDF (BabIII)
Bab.III_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (987kB)
[img] PDF (BabIV)
Bab.IV_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (1MB)
[img] PDF (BabV)
Bab.V_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (91kB)
[img]
Preview
PDF (DaftarPustaka)
Daftar pustaka_1.pdf

Download (168kB) | Preview
[img] PDF (Lampiran)
Lampiran_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (979kB)

Abstract

Duku (Lansium domesticum) is one of local fruit which deploy along South East Asia, including Indonesia, Thailand, and Malaysia. Indonesia has high genetic diversity levels which cause each local duku cultivars can be different in character one to another. Several parts of region came out as duku market centre because it has sweeter taste which favorable to the consumer, one of those is duku Kalikajar from Purbalingga. The genetic diversity information of duku is important to support the development of new varieties. This research aims to study genetic diversity as well its relatedness among duku accessions from several parts of Banjarnegara, Banyumas, and Purbalingga with RAPD marker. This research was conducted at Plant Breeding and Biotechnology Laboratory of Agriculture Faculty, Jenderal Soedirman University, from November 2016 to June 2017. Randomized sampling was done around market centre area of duku in three districts of Banjarnegara, Kembaran district of Banyumas, and Kaligondang district of Purbalingga which very famous for its Duku Kalikajar from Kalikajar village. Variable observed is DNA band from PCR amplification using 5 RAPD markers. Scoring value was used to calculate PIC from each primer and reconstruct genetic relatedness among accessions. Phylogenetic tree is obtained from analysis in MEGA ver 6.06 with UPGMA method. The result had shown that eleven duku accessions from Purbalingga, Banyumas, and Banjarnegara were considered have high genetic diversity, based on average PIC values from five primers that defined as highly informative, which was 0,66. Eleven duku accessions can be grouped into three clusters based on band pattern from DNA amplification with five RAPD markers. First cluster exposed that most of Purbalingga accessions, including Kalikajar, were closely related to several accessions from Banjarnegara and Banyumas. The second cluster showed close relation between Sigaluh accessions from Banjarnegara and Wirasana accessions from Purbalingga. In the other hand, third cluster which was basal cluster has separated Wanadadi accession from Banjarnegara because there was quite distant relation with other accessions, as far as 0,52 on UPGMA distance index. Keywords: Duku (Lansium domesticum) merupakan komoditas buah yang memiliki daerah penyebaran di Asia Tenggara, termasuk Indonesia, Thailand, dan Malaysia. Tingkat keragaman genetik yang tinggi menyebabkan setiap kultivar lokal duku di Indonesia memiliki karakter yang berbeda antar daerah. Beberapa daerah kemudian menjadi sentra duku karena rasanya yang dikenal lebih manis dan disukai konsumen, salah satunya adalah duku Kalikajar dari Purbalingga. Informasi tentang keragaman genetik duku penting untuk mendukung adanya varietas unggul baru. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui keragaman genetik serta hubungan kekerabatan antara aksesi duku dari beberapa daerah di Banjarnegara, Banyumas, dan Purbalingga dengan menggunakan marka RAPD. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi Fakultas Pertanian Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto, mulai November 2016 sampai Juni 2017. Pengambilan sampel dilakukan secara acak berdasarkan daerah yang menjadi sentra duku di tiga Kecamatan di Kabupaten Banjarnegara, Kecamatan Kembaran di Banyumas, dan Kecamatan Kaligondang, Purbalingga, yang salah satunya merupakan daerah yang sudah dikenal sebagai sentra buah Duku, yaitu desa Kalikajar. Variabel yang diamati adalah pita hasil amplifikasi DNA dengan PCR menggunakan marka RAPD. Hasil skoring digunakan untuk rekonstruksi hubungan kekerabatan dan menentukan PIC setiap primer. Pohon kekerabatan didapatkan dari analisis hasil skoring menggunakan software MEGA ver. 6.06 dengan metode UPGMA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebelas aksesi duku dari Purbalingga, Banyumas, dan Banjarnegara memiliki tingkat keragaman genetik yang tinggi, berdasarkan rata-rata nilai PIC dari lima primer yang tergolong sangat informatif, yaitu 0,66. Kesebelas aksesi duku dapat dikelompokan menjadi tiga klaster berdasarkan analisis pola pita hasil amplifikasi DNA dengan lima primer RAPD. Klaster pertama menunjukkan hampir semua aksesi duku dari Purbalingga, termasuk Kalikajar, berkerabat dekat dengan beberapa aksesi dari Banjarnegara dan Banyumas. Klaster kedua menunjukan bahwa aksesi duku Sigaluh dari Banjarnegara berkerabat dekat dengan aksesi Wirasana dari Purbalingga. Sedangkan klaster tiga merupakan klaster tunggal yang memisahkan duku Wanadadi asal Banjarnegara karena jarak kekerabatan yang lebih jauh dengan aksesi lainnya sejauh 0,52 pada indeks jarak UPGMA.

Item Type: Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris: A17297
Uncontrolled Keywords: Lansium domesticum, genetic relatedness, RAPD Lansium domesticum, hubungan kekerabatan, RAPD
Subjects: P > P322 Plant physiology
P > P329 Plants Analysis
Divisions: Fakultas Pertanian > S1 Agroteknologi
Depositing User: Mrs Endang Kasworini
Date Deposited: 23 Jan 2019 08:10
Last Modified: 23 Jan 2019 08:10
URI: http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/736

Actions (login required)

View Item View Item

Downloads

Downloads per month over past year