PURWANINGTYAS, Widya Esti (2018) Karakterisasi Molekuler Isolat Aktinomisetes Tanah Perakaran Mangrove Segara Anakan Cilacap berdasarkan Gen Nonribosomal Peptide Synthetase. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Download (140kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (409kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Download (129kB)
	PDF (BabI) BAB I WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (246kB)
	PDF (BabII) BAB II WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (252kB)
	PDF (BabIII) BAB III WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (436kB)
	PDF (BabIV) BAB IV WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (781kB)
	PDF (BabV) BAB V WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (124kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Download (362kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN WIDYA ESTI P_B1J014108.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Aktinomisetes merupakan bakteri Gram positif yang bersifat aerobik, berbentuk batang filamen dengan hifa bercabang. Aktinomisetes dikenal karena kemampuannya dalam mensintesis senyawa metabolit sekunder yang dapat bermanfaat sebagai antibiotik, imunosupresan, herbisida, fungisida, insektisida dan antiparasit. Oleh karena itu aktinomisetes digunakan sebagai fokus dalam eksplorasi senyawa bioaktif baru. Namun, potensi aktinomisetes dari daerah perakaran mangrove masih sangat terbatas pengembangannya. Pendekatan secara molekuler diperlukan dalam usaha pencarian senyawa bioaktif baru yang lebih menghemat tenaga, waktu dan sebagai pelengkap dalam proses skrining secara konvensional. Pendekatan secara molekuler dapat dilakukan melalui deteksi gen NRPS. Gen tersebut bertanggung jawab dalam sistem biosintetik senyawa nonribosomal peptida dan poliketida. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui karakter gen NRPS isolat aktinomisetes asal tanah perakaran mangrove Segara Anakan, Cilacap berdasarkan atas sekuen gen NRPS. Penelitian ini dilaksanakan menggunakan metode survey dengan analisis deskriptif. Parameter yang diamati meliputi parameter utama dan parameter pendukung. Parameter utama yang diamati pada penelitian ini adalah Index Similarity urutan nukleotida gen NRPS aktinomisetes. Parameter pendukung adalah ukuran pita sekuen gen NRPS dan karakter makromorfologi serta mikromorfologi. Hasil sekuening kemudian akan di analisis secara deskriptif menggunakan program BLAST pada website NCBI . Hasil penelitian yang diperoleh menunjukkan bahwa 5 isolat aktinomisetes termasuk dalam genus Streptomyces. Gen NRPS isolat E40FS memiliki kemiripan 78% dengan gen NRPS isolat Streptomyces sp. Tue6075 dengan dan diprediksi mampu menghasilkan vancostatine, complestatine, dan enduradin. Gen NRPS isolat B2SCN4 memiliki kemiripan 78% dengan gen NRPS Streptomyces albulus strain CK-15 dan diprediksi mampu menghasilkan arylomycin, laspartomycin dan teleocidin. Gen NRPS isolat C45.10.6 memiliki kemiripan 90% dengan gen NRPS Streptomyces sp. XZH99 dan diprediksi mampu menghasilkan capreomycin dan bleomycin. Gen NRPS isolat SA38 memiliki kemiripan 77% dengan gen NRPS Streptomyces alfalfae strain ACCC40021 dan diprediksi mampu menghasilkan staurosporine. Gen NRPS isolat E44.10.C memiliki kemiripan 94% dengan gen NRPS Streptomyces rochei yang diprediksi mampu menghasilkan complestatine.

Actions (login required)

View Item