Studi Virtual Skrining Turunan Flavonoid dari Genus Artocarpus melalui Penambatan Molekul sebagai Inhibitor Tirosin Kinase

PRADANA, Radiktya Surya (2021) Studi Virtual Skrining Turunan Flavonoid dari Genus Artocarpus melalui Penambatan Molekul sebagai Inhibitor Tirosin Kinase. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

[img] PDF (Cover)
COVER-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf

Download (206kB)
[img] PDF (Legalitas)
LEGALITAS-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (2MB)
[img] PDF (Abstrak)
ABSTRAK-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf

Download (336kB)
[img] PDF (BabI)
BAB I-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (348kB)
[img] PDF (BabII)
BAB II-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (590kB)
[img] PDF (BabIII)
BAB III-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (965kB)
[img] PDF (BabIV)
BAB IV-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (650kB)
[img] PDF (BabV)
BAB V-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (320kB)
[img] PDF (DaftarPustaka)
DAFTAR PUSTAKA-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf

Download (353kB)
[img] PDF (Lampiran)
LAMPIRAN-Radiktya Surya P-I1C017039-SKRIPSI-2021.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (3MB)

Abstract

Latar Belakang: Dalam pengembangan obat antikanker, epidermal growth factor receptor (EGFR) telah terbukti menjadi target yang layak untuk dilakukan studi lebih lanjut. Salah satu pendekatan terapi dengan target EGFR yang dapat digunakan yaitu inhibitor tirosin kinase. Senyawa flavonoid dilaporkan berpotensi sebagai inhibitor tirosin kinase. Penelitian ini bertujuan untuk mencari senyawa turunan flavonoid dari genus Artocarpus sebagai inhibitor EGFR akibat adanya perkembangan mutasi pada EGFR. Metodologi: Virtual skrining terhadap inhibitor tirosin kinase dengan target protein EGFRL858R/T790M (PDB ID :6JX4) dilakukan melalui metode penambatan molekul dengan kontrol obat osimertinib dan olmutinib. Preparasi protein dengan menghilangkan molekul air dan memisahkan molekul reseptor dan ligan natif dalam file PDB terpisah. Reseptor ditambatkan dengan ligan natif dan mendapatkan koordinat grid box. Nilai RMSD ditentukan dari hasil penambatan tersebut. Penambatan senyawa uji dengan reseptor dilakukan menggunakan koordinat hasil validasi yang valid. Konformasi dengan energi terendah divisualisasi. Hasil Penelitian: Validasi menunjukkan nilai RSMD yaitu 1.97 Å. Energi ikatan terendah yaitu -10,0 kkal/mol untuk senyawa ACP35 sedangkan untuk kontrol olmutinib dan osimertinib masing masing adalah -8,2 kkal/mold an -7,2 kkal/mol Hasil visualisasi pada senyawa ACP35 menunjukkan ikatan hidrogen terhadap LYS745 dengan jarak 3,17Å; ikatan hidrofobik meliputi pi-sigma (LEU718, VAL726), alkil (MET790, VAL726, LEU718, LYS745), pi-alkyl (ALA743, LEU844, LEU718); dan interaksi akseptor-akseptor (MET793). Kesimpulan: Senyawa ACP35 berpotensi sebagai inhibitor EGFR.

Item Type: Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris: I21096
Uncontrolled Keywords: EGFR, EGFRL858R/T790M, inhibitor tirosin kinase, virtual skrinning, penambatan molekul
Subjects: A > A311 Analytical chemistry
D > D333 Drugs Testing
Divisions: Fakultas Ilmu Ilmu Kesehatan > S1 Farmasi
Depositing User: Mr Radiktya Surya Pradana
Date Deposited: 21 May 2021 01:15
Last Modified: 21 May 2021 01:15
URI: http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/9776

Actions (login required)

View Item View Item

Downloads

Downloads per month over past year