Karakterisasi Molekuler Ikan Gurami Batanghari (Osphronemus Goramy Lac.) Hasil Tangkapan di Alam dan Penangkaran

AMALIA, Gina (2017) Karakterisasi Molekuler Ikan Gurami Batanghari (Osphronemus Goramy Lac.) Hasil Tangkapan di Alam dan Penangkaran. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

[img]
Preview
PDF (Cover)
cover_1.pdf

Download (18kB) | Preview
[img] PDF (Legalitas)
Legalitas dan Bagian Awal Tugas Akhir_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (697kB)
[img]
Preview
PDF (Abstrak)
Abstrak_1.pdf

Download (213kB) | Preview
[img] PDF (BabI)
Bab I_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (99kB)
[img] PDF (BabII)
Bab II_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (417kB)
[img] PDF (BabIII)
Bab III_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (218kB)
[img] PDF (BabIV)
Bab IV_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (258kB)
[img] PDF (BabV)
Bab V_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (85kB)
[img] PDF (Daftarpustaka)
Daftar Pustaka_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (224kB)
[img] PDF (Lampiran)
lampiran_1.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (1MB)

Abstract

Ikan Gurami (Osphronemus goramy Lac.) merupakan ikan yang tersebar di kawasan tropis mulai dari India sampai Semenanjung Malaya dan Indonesia. Berbagai strain ikan Gurami telah banyak dibudidayakan di Indonesia. Salah satu strain ikan Gurami yang baru saja dilepas pada tanggal 30 Maret 2015 oleh Kementerian Kelautan dan Perikanan adalah ikan Gurami Batanghari. Ikan Gurami Batanghari hasil budidaya atau penangkaran di duga mengalami perubahan secara genetik jika dibandingkan dengan ikan Gurami Batanghari hasil tangkapan di alam karena adanya upaya seleksi yang dapat menghilangkan materi genetik. Oleh karena itu, diperlukan karakterisasi secara molekuler untuk mengetahui ada tidaknya perbedaan genetik diantara keduanya. Salah satu penandamolekuler yang dapat digunakan untuk karakterisasi adalah gen sitokrom c oksidase I (COI). Gen COl memiliki laju mutasi yang cukup tinggi, sehingga dapat memperlihatkan perbedaan antar individu dalam satu spesies yang sama. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode survey. Sampel yang digunakan adalah jaringan sirip ekor koleksi Laboratorium Taksonomi Hewan Fakultas Biologi Unsoed. Penelitian ini diawali dengan melakukan ekstraksi DNA dari sampel sirip ikan, amplifikasi fragmen gen COI mtDNA ikan, elektroforesis gel agarosa, dan DNA sekuensing. Sekuen yang diperoleh diedit menggunakan software Bio-Edit. Keragaman genetik diduga secara statistik menggunakan analysis of molecular variance (AMOVA) dengan bantuan software Arlequin serta hubungan kekerabatan dianalisis dengan cara merekonstruksi pohon filogenetik menggunakan algoritma Neighbor-Joining dengan bantuan software MEGA 6. Analysis of molekuler variance dengan model K2P menunjukkan bahwa kedua populasi ikan Gurami Batanghari tidak berbeda (indek fiksasi/Fst= 0,00; p= 0,99). Namun jika dilihat secara rinci pada setiap populasi, populasi alami (BA) memiliki keragaman haplotipe (h) yang tinggi yaitu 1,00 +/- 0,06 ; keragaman nukleotida (π) 6% ; polimorfisme 17,9%. Demikian halnyajuga dengan populasi hasil penagkaran. Populasi hasil penagkaran (BT) nilai keragaman haplotipe (h) 1,00 +/-0,05 ; keragaman nukleotida (π) 4% ; polimorfisme 16,4%. Hasil AMOVA didukung oleh hasil analisis filogeni yang memperlihatkan bahwa anggota kedua populasi tersebar acak pada percabangan pohon. Analisis filogenetik mendukung hasil analisis amova dengan adanya penyebaran secara acak dari anggota kedua populasi gurami yang diteliti pada percabanagn pohon. Nilai bootstrap tertinggi terdapat pada clade ke dua dengan nilai 100 yang terdiri dari BA 5, BA 6, dan BT 6. Berdasarkan marka molekuler yang digunakan dapat disimpulkan bahwa kedua populasi ikan gurami yang diteliti tidak memiliki perbedaan genetik meskipun kedua populasi memiliki keragaman haplotipe dan keragaman nukleotida yang tinggi. Kata kunci: Ikan Gurami Batanghari, DNA Sekuensing, Gen Sitokrom C Oksidase I (COI), Indek Fiksas

Item Type: Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris: B17036
Uncontrolled Keywords: Ikan Gurami Batanghari, DNA Sekuensing, Gen Sitokrom C Oksidase I (COI), Indek Fiksas
Subjects: F > F181 Fish culture
F > F183 Fishes Ecology
Divisions: Fakultas Biologi > S1 Biologi
Depositing User: Mrs Sri Hartati
Date Deposited: 24 Jun 2020 07:45
Last Modified: 24 Jun 2020 07:45
URI: http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/1965

Actions (login required)

View Item View Item