PUTRIANA, Eka (2025) Molecular Genotyping Berbasis PCR pada Beberapa Genotipe Padi dengan Berbagai Kandungan Antosianin. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Download (181kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Restricted to Repository staff only Download (327kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Download (229kB)
	PDF (BabI) BAB-I- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Restricted to Repository staff only until 12 January 2027. Download (225kB)
	PDF (BabII) BAB-II- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Restricted to Repository staff only until 12 January 2027. Download (270kB)
	PDF (BabIII) BAB-III- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Restricted to Repository staff only until 12 January 2027. Download (276kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Restricted to Repository staff only Download (485kB)
	PDF (BabV) BAB-V- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Download (232kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Download (227kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN- Eka Putriana-A1D021028-Skripsi-2026.pdf Restricted to Repository staff only Download (437kB)

Abstract

Padi (Oryza sativa L.) merupakan tanaman yang termasuk dalam suku padi-padian atau Poaceae (sinonim Graminae atau lumiflorae) (Rosanti, 2016). Padi berpigmen masuk ke dalam pangan fungsional karena memiliki kandungan antosianin. Antosianin adalah glikosida yang larut dalam air dan merupakan acyl glycosides dari antosianidin sayuran, buah-buahan, serta biji-bijian sereal. Program pemuliaan padi berpigmen telah dilakukan melalui tahapan seleksi tetua yang dilakukan dengan memilih varietas padi yang memiliki kandungan pigmen tinggi, peningkatan keragaman genetik yang bertujuan untuk memperoleh kombinasi sifat unggul, seleksi genotipe potensial, evaluasi karakter unggul, hingga pelepasan varietas baru yang memiliki keunggulan. Tujuan penelitian yang dilakukan yaitu untuk mendapatkan dan mengembangkan marka molekuler serta metode PCR yang dapat mendeteksi dan memfasilitasi seleksi gen terkait sifat antosianin pada tanaman padi sebagai dasar pengembangan pemuliaan tanaman yang efisien. Penelitian dilaksanakan di Experimental Farm Fakultas Pertanian Unsoed, Laboratorium Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi Fakultas Pertanian Unsoed, Laboratorium Riset Unsoed, dan Laboratorium Bioteknologi Peternakan Integrated Academic Building (IAB) Unsoed. Penelitian dilaksanakan dari bulan Juli 2024 sampai September 2025. Sampel yang digunakan terdiri dari 8 genotipe padi, yaitu Basmati, Logawa, Inpari 31, Cilosari, Inpari 24, Jeliteng, BMA (lokal Bumiayu), KBN (lokal Kebumen). Delapan genotipe padi tersebut diuji untuk mengetahui karakter genetik antosianinnya menggunakan teknik PCR dengan primer RC12, RM336, RM3400, dan RM252. Proses ekstraksi DNA dilakukan menggunakan metode CTAB, kemudian dilanjutkan dengan pengujian kualitas dan kuantitas DNA menggunakan spektrofotometri dan elektroforesis gel agarosa. Tahap amplifikasi menggunakan alat thermal cycler. Produk PCR yang dihasilkan dianalisis melalui elektroforesis gel agarosa 2% untuk memvisualisasikan pola pita DNA yang terbentuk. Analisis data dilakukan dengan mengamati kemunculan dan kesamaan pita DNA yang terbentuk dari masing-masing sampel dengan kandungan antosianin yang kemudian dibandingkan dengan referensi yang digunakan dan juga dilakukan dengan metode klaster UPGMA melalui program NTSYS-pc 2.1 untuk menghasilkan dendrogram kekerabatan. Hasil menunjukan bahwa marka SSR (Simple Sequence Repeat) RM336, RM252, dan RM3400 jika digunakan secara bersamaan mampu membedakan varietas padi berdasarkan pigmentasi perikarp/aleuron, sedangkan ketika digunakan secara individual ketiga marka tersebut kurang efektif untuk membedakan padi berpigmen dan non-pigmen. Dan RC12 tidak bisa (bersifat monomorfik) digunakan untuk pembeda pigmentasi aleuron pada delapan varietas yang diuji.

Item Type:	Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris:	A25504
Uncontrolled Keywords:	Antosianin, RM336, RM252, RM3400, RC12, Dendrogram Kekerabatan
Subjects:	M > M470 Molecular biology P > P328 Plants
Divisions:	Fakultas Pertanian > S1 Agroteknologi
Depositing User:	Mrs. Eka Putriana
Date Deposited:	12 Jan 2026 07:26
Last Modified:	12 Jan 2026 07:26
URI:	http://repository.unsoed.ac.id:443/id/eprint/38904

Actions (login required)

View Item