SAFITRI, Salsabila Nur (2026) DNA Barcoding, Metabolomik Profiling dan Potensi Antikanker Makroalga Merah (Rhodophyta) di Pantai Sepanjang, Gunung Kidul. Masters thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Download (164kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Restricted to Repository staff only Download (512kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Download (174kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Restricted to Repository staff only until 26 February 2027. Download (240kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Restricted to Repository staff only until 26 February 2027. Download (803kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Restricted to Repository staff only until 26 February 2027. Download (412kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Download (152kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Download (318kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Salsabila Nur Safitri-P2C023005-Tesis-2026.pdf Restricted to Repository staff only Download (5MB)

Abstract

Pantai Sepanjang merupakan kawasan pesisir dengan keanekaragaman makroalga merah (Rhodophyta) yang tinggi. Namun, identifikasi berbasis morfologi sering terkendala oleh plastisitas antarspesies. DNA barcoding digunakan sebagai metode yang lebih akurat untuk identifikasi spesies makroalga merah. Hasil genetik yang diperoleh menjadi dasar karakterisasi senyawa bioaktif melalui pendekatan metabolomik profiling menggunakan Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry (LC-HRMS). Pemilihan metode ekstraksi yang tepat dalam hal ini menjadi faktor penting untuk mengoptimalkan perolehan senyawa bioaktif tersebut. Senyawa bioaktif makroalga merah dilaporkan memiliki efek antikanker yang signifikan, sehingga relevan untuk diteliti mengingat kanker masih menjadi tantangan utama dalam dunia medis. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan mengungkap identitas genetik makroalga merah melalui pendekatan DNA barcoding guna mendukung pemanfaatannya sebagai sumber kandidat agen antikanker berbasis sumber daya lokal. Penelitian ini merupakan penelitian eksploratif yang dilakukan di kawasan pesisir Pantai Sepanjang. Sebanyak empat sampel makroalga merah dikoleksi pada awal tahun 2024 untuk diidentifikasi lebih lanjut. Identifikasi spesies dilakukan melalui pendekatan DNA barcoding menggunakan penanda gen cox1 (COI-5P), cox2–3 spacer, dan rbcL. Tahapan penelitian meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi PCR, sekuensing, hingga analisis filogenetik menggunakan metode bootstrap dan Bayesian Inference. Analisis filogenetik dilakukan menggunakan perangkat lunak BioEdit dan MEGA11. Ekstraksi senyawa bioaktif makroalga merah dilakukan menggunakan metode maserasi bertingkat, heat-assisted extraction (HAE), dan microwave extraction (ME). Analisis metabolomik berbasis LC-HRMS menghasilkan data spektra massa. Data spektra tersebut dianotasi dan dianalisis menggunakan pendekatan molecular networking melalui GNPS dan Cytoscape. Senyawa kandidat yang teridentifikasi ditelusuri potensi antikankernya melalui Scopus. Hasil identifikasi spesies menunjukkan empat spesimen sebagai Aneurianna sp., Gracilaria sp., Gracilaria salicornia, dan Acanthophora spicifera. Maserasi dengan akuades memberikan rendemen tertinggi sebesar 16,475% BK (Berat kering) dalam 2 × 24 jam, sementara metode ME terbukti lebih efisien dengan perolehan 11,24% BK dalam 5 menit. Kedua nilai rendemen tersebut diperoleh dari ekstraksi spesimen Gracilaria sp. Rendemen ekstrak cenderung meningkat seiring bertambahnya polaritas pelarut menunjukkan bahwa makroalga merah didominasi oleh senyawa polar dan semipolar. Analisis molecular networking berbasis GNPS mendereplikasi empat senyawa utama, yaitu pheophorbide A m/z 539.261 [M+H]+, erucamide m/z 338.34 [M+H]+, 13-docosenamide m/z 675.662 [2M+H]+, dan diacylglyceryl-trimethylhomoserine (DGTS) m/z 656.547 [M+H]+. Berdasarkan penelusuran literatur berbasis Scopus, keempat senyawa tersebut dilaporkan memiliki aktivitas sebagai agen antikanker. Senyawa pheophorbide A menunjukkan potensi paling menjanjikan sebagai agen terapi antikanker berbasis fotodinamik. Senyawa ini berperan sebagai fotosensitizer yang mampu menghasilkan spesies oksigen reaktif secara selektif pada sel kanker.

Item Type:	Thesis (Masters)
Nomor Inventaris:	P226098
Uncontrolled Keywords:	DNA barcoding, Makroalga merah, Metabolomik profiling, LC-HRMS, Potensi antikanker
Subjects:	B > B306 Botany Medicine Pharmacy M > M72 Marine plants
Divisions:	Program Pascasarjana & Profesi > S2 Bioteknologi Pertanian
Depositing User:	Mrs Salsabila Nur Safitri
Date Deposited:	26 Feb 2026 04:43
Last Modified:	26 Feb 2026 04:43
URI:	http://repository.unsoed.ac.id:443/id/eprint/40269

Actions (login required)

View Item