SUGIHARTOYO, Muhammad (2024) Keragaman Genetik Ikan Nilem (Osteochilus Vittatus) dari Jawa dan Sumatera Berdasarkan Gen Cytochrome Oxydase-1 (CO1). Masters thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Download (479kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (3MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Download (193kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 12 February 2025. Download (268kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 12 February 2025. Download (772kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 12 February 2025. Download (841kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (4MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Download (111kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Download (363kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Muhammad Sugihartoyo-L2B019001-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Ikan Nilem hidup tersebar di berbagai perairan dan kehidupannya tidak lepas dari pengaruh lingkungan. Hal ini memungkinkan struktur dan morfologinya menyesuaikan dengan lingkungan sekitar sehingga memunculkan variasi variasi morfologi. Penelitian dan pengetahuan tentang keragaman genetik ikan Nilem masih sangat sedikit. Keragaman genetik penting keberadaanya di dalam populasi untuk mempertahankan kelestarian di alam dan kegiatan budidaya ikan yang berkelanjutan. Tujuan yang ingin dicapai dari penelitian ini adalah analisis keragaman genetik dan hubungan filogenetik ikan Nilem dari Pulau Jawa dan Pulau Sumatera berdasarkan sekuen gen CO1. Materi yang digunakan pada penelitian ini adalah ikan Nilem (Osteochilus vittatus) dari Kabupaten Magelang, Kabupaten Klaten, Kabupaten Banyumas, Kota Bandar Lampung, Kabupaten Muaro Jambi, Kabupaten Padang Pariaman. Metode penelitian yang digunakan adalah metode observasi. Penelitian ini menggunakan DNA Sekuensing untuk analisis keragaman genetik ikan Nilem dengan menggunakan gen CO1 sebagai penanda. Hasil analisis Multiple Sequence Alignment sampel ikan Nilem setelah dilakukan trim/pemotongan didapatkan panjang sekuens parsial gen CO1 sebesar 652 bp dan terdapat 642 daerah conserved, sedangkan variable site/daerah polimorfik sebanyak 12 site. Berdasarkan analisis jarak genetik, kergaman genetik ikan Nilem termasuk kategori rendah. Nilai jarak genetik terendah yaitu 0,0000 dan jarak genetik tertinggi yaitu 0,0140. Rekonstruksi pohon filogenetik menunjukan keragaman ikan Nilem di Jawa dan Sumatera rendah. Hal ini dapat dilihat pada panjang cabang yang pendek. Namun percabangan terbentuk signifikan, di mana ada dua cabang utama untuk nilem. Sampel penelitian ini juga terkelompok ke dalam dua cabang tersebut.

Actions (login required)

View Item