NURANI, Sekar Cahyo (2021) Efek Penambatan Senyawa 6-Shogaol dan Kurkumin terhadap Protein DNMT1 dan LSD1. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Download (168kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (597kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Download (222kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (211kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (319kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (219kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (200kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Download (232kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Sekar Cahyo Nurani-I1C017041-Skripsi-2021.pdf.pdf Restricted to Repository staff only Download (7MB)

Abstract

Beta talasemia adalah penyakit herediter yang ditandai dengan menurunnya produksi beta-globin. 6-shogaol dan kurkumin diketahui dapat meningkatkan kadar HbF dengan penghambatan ekspresi dari mRNA STAT3 pada sel K562. Penelitian ini bertujuan untuk melihat interaksi 6-shogaol dan kurkumin pada protein DNMT1 dan LSD1. Preparasi protein dengan menghilangkan molekul air dan memisahkan molekul reseptor dan ligan natif dalam file PDB terpisah. Reseptor ditambatkan dengan ligan natif dan mendapatkan koordinat grid box. Nilai RMSD ditentukan dari hasil penambatan tersebut. Penambatan senyawa uji dengan reseptor dilakukan menggunakan koordinat hasil validasi yang valid. Konformasi dengan energi terendah akan divisualisasi Validasi menunjukkan nilai RMSD yaitu 0,861 Å (DNMT1) dan 1,410 Å (LSD1). Energi ikatan terendah pada protein DNMT1 yaitu -6,5 kkal/mol pada 6-shogaol dan -8,0 kkal/mol pada kurkumin. Energi ikatan terendah untuk protein LSD1 yaitu -8,2 kkal/mol untuk senyawa 6-shogaol dan -10,1 kkal/mol untuk senyawa kurkumin. Residu asam amino pada DNMT1 yang berperan pada pengikatan senyawa uji yaitu Gly1147; Phe1145; Glu1168; Asn1278; Pro1225; Leu1151; Val1580; Ala1579; Asn1578; Trp1170; Ala1579. Residu asam amino pada LSD1 yang berperan pada pengikatan senyawa uji yaitu Val288; Ser289; Arg310; Gly285; Thr624; Leu659; Lys661; Arg316; Leu625; Tyr761; Trp751; Gly330; Leu659. Kurkumin memiliki interaksi yang lebih potensial pada DNMT1 dan LSD1 dibandingkan 6-shogaol.

Actions (login required)

View Item