RAFDI, Muhammad Abi (2020) Penambatan Molekuler Senyawa Turunan Isoflavon sebagai Penghambat Protein Tyrosine Phosphatase-1b (PTP-1B). Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Download (1MB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Download (1MB)
	PDF (BabI) BAB-I-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabII) BAB-II-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Download (2MB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Muhammad Abi Rafdi-I1C016029-Skripsi-FIKES-2020.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)

Abstract

Latar Belakang: Senyawa turunan isoflavon diketahui memiliki aktivitas antidiabetes dengan menghambat PTP-1B, diantaranya adalah senyawa 6,8 diprenylorobol, Auriculasin, dan Osajin yang memiliki aktivitas biologis terhadap PTP-1B. Penelitian ini bertujuan melakukan pendekatan in silico terhadap ketiga senyawa tersebut dengan metode penambatan molekuler sehingga dapat menjadi dasar untuk pengembangan suatu senyawa baru. Metodologi: Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental yang dilakukan dalam dua tahap. Pertama, validasi metode yang meliputi pengunduhan struktur PTP-1B dari Protein Data Bank, preparasi struktur protein, penambatan kembali dengan Ligan Natif menggunakan AutoDock Vina, dan penghitungan nilai RMSD. Kedua, penambatan molekuler senyawa 6,8-diprenylorobol, Auriculasin, dan Osajin yang meliputi penambatan dengan AutoDock Vina, dan visualisasi penambatan dengan menggunakan BIOVIA Discovery Studio 2020. Hasil Penelitian: Diperoleh nilai energi ikatan dengan rentang -6,5 – -7,8 kkal/mol pada ketiga senyawa tersebut. Pada visualisasi penambatan, terjadi interaksi pada senyawa 6,8-diprenylorobol ikatan hidrogen terhadap Cys215, Gly220, dan Arg221; interaksi elektrostatik terhadap Asp181 dan Arg221; dan interaksi hidrofobik terhadap Tyr46, Arg47, Cys215, dan Ala217. Senyawa Auriculasin memiliki ikatan hidrogen terhadap Ser118; interaksi elektrostatik terhadap Asp48 dan Lys120; dan interaksi hidrofobik pada Phe182, Ala217, dan Ile219. Senyawa Osajin memiliki ikatan hidrogen terhadap Arg221; Pi-Donor Hydrogen Bond terhadap Tyr46; dan interaksi elektrostatik terhadap Tyr46, Cys215, dan Ala217. Kesimpulan: Senyawa 6,8-diprenylorobol secara in silico menunjukkan hasil yang paling baik, ditunjukkan dengan nilai energi yang rendah dan ikatan dengan residu asam amino paling banyak.

Actions (login required)

View Item