ARIFAH, Nur (2022) Studi Potensi Senyawa Aktif dari Bahan Alam sebagai Inhibitor Platelet Derived Growth Factor Receptor-Alfa. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Download (185kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only Download (2MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Download (422kB)
	PDF (BabI) BAB-I- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only until 10 August 2023. Download (421kB)
	PDF (BabII) BAB-II- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only until 10 August 2023. Download (718kB)
	PDF (BabIII) BAB-III- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only until 10 August 2023. Download (625kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only Download (976kB)
	PDF (BabV) BAB-V- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Download (313kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Download (337kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN- Nur Arifah-I1C018029-Skripsi-2022.pdf Restricted to Repository staff only Download (500kB)

Abstract

Latar Belakang: Ekspresi berlebih suatu enzim seperti platelet derived growth factor receptor alfa (PDGFRα) dapat menyebabkan perkembangan kanker. Beberapa senyawa alam yang secara empiris digunakan sebagai pengobatan dan diketahui memiliki aktivitas terhadap sel kanker diantaranya α-mangostin, andrographolide, galangin, gamma mangostin, pinostrobin, pinocembrin, Ethyl p-methoxycinnamate (EPMC), xanthorrhizol, curcumin, cinamaldehyde, dan alashanoid B. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui senyawa yang paling berpotensi sebagai inhibitor PDGFRα berdasarkan hasil penambatan molekuler dan aturan Lipinski, sehingga dapat menjadi dasar pengembangan obat baru. Metodologi: Penambatan molekuler yang dilakukan dengan mengunduh struktur PDGFRα dari PDB, preparasi struktur protein menggunakan AutoDock Tools, penambatan kembali dengan ligan natif menggunakan AutoDock Vina, perhitungan RMSD menggunakan PyMOL, penambatan molekuler senyawa uji, dan visualisasi hasil penambatan pada BIOVIA Discovery Studio. Selanjutnya uji aturan Lipinski dilakukan pada web SCFBio. Hasil Penelitian: Hasil penambatan molekuler 11 senyawa menunjukan pinocembrin, galangin dan pinostrobin (golongan flavonoid) sebagai senyawa uji yang memiliki energi ikatan terendah sebesar -9,6 kkal/mol, -9,4 kkal/mol dan -9,3 kkal/mol, sementara senyawa kontrol sunitinib sebesar -8,9 kkal/mol dan ligan natif imatinib sebesar -14,5 kkal/mol. Pada visualisasi penambatan ketiga senyawa flavonoid terdapat residu asam amino yang mengikat situs aktif PDGFRα yaitu GLU644, LYS627, ASP836, CYS677, THR674 dan VAL607. Semua senyawa uji memenuhi syarat aturan lipinski dengan berat molekul < 500 dalton, jumlah hidrogen donor < 5, jumlah akseptor hidrogen < 10, nilai log P <5, dan refraktivitas molar diantara 40-130. Kesimpulan: Senyawa flavonoid berpotensi sebagai inhibitor PDGFRα dan memiliki prediksi sifat fisikokimia yang baik berdasarkan hasil uji lipinski.

Actions (login required)

View Item