MUHIDIN, Abdul Rahman (2024) Studi Filogenetika Teritip Spons Yang Ditemukan Di Perairan Pantai Kepulauan Karimunjawa Berdasarkan Marka Genetik Mtdna Sitokrom C Oksidase I. Masters thesis, Universita Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Download (300kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (802kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Download (439kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 14 August 2025. Download (554kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 14 August 2025. Download (505kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 14 August 2025. Download (749kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Download (441kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024 (1).pdf Download (656kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Abdul Rahman Muhidin-B2A020003-Tesis-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (682kB)

Abstract

Teritip spons ditemukan hampir di seluruh perairan di dunia termasuk Indonesia, salah satunya adalah perairan kepulauan karimunjawa. Sistem klasifikasi atau taksonomi dari teritip spons telah beberapa kali mengalami perubahan atau revisi sehingga perlu dilakukan penelitian untuk identifikasi lebih lanjut baik untuk memvalidasi status taksonomi organisme tersebut. Penelitian dimulai dengan proses koleksi spesimen teritip spons dan spons inangnya pada enam titik lokasi mengelilingi area kepulauan Karimunjawa selama 4 hari. Spesimen-spesimen teritip yang telah ditemukan kemudian dilakukan proses identifikasi morfologi dan divalidasi kembali melalui proses identifikasi molekuler. Identifikasi dilakukan berdasarkan perbedaan struktur cangkang dan operculum plate dari setiap spesies. Hasil identifikasi morfologi mendapatkan ada tiga jenis atau spesies berbeda yaitu Membranobalanus longirostrum, Acasta coriolis, dan Acasta fenesrata. Identifikasi dilanjutkan dengan melalukan ekstraksi DNA dari jaringan setiap spesimen untuk kemudiaan dilakukan amplifikasi DNA dengan proses Polymerase Chain Reaction (PCR) mengggunakan marka genetik cytochrome oxidase subunit I (CO1). Data sekuen DNA dari proses identifikasi molekuler kemudian akan digunakan untuk merekonstruksi pohon filogenetik dari setiap spesimen tersebut. Hasil identifikasi molekuler mendapatkan bahwa ketiga spesimen tersebut merupakan tiga spesies berbeda. Adanya permasalahan kolektifitas referensi sekuen spesie-spesies teritip spons dalam data GenBank dan masalah kontaminasi pada proses identifikasi genetik menyebabkan hanya satu jenis teritip spons yang berhasil teridentifikasi identitas spesiesnya yaitu spesies Acasta fenestrata. Spesimen yang diduga Membranobalanus longirostrum tervalidasi merupakan spesimen dari Genus Membranobalanus dan spesimen yang diduga Acasta coriolis masih belum tervalidasi karena adanya kemungkinan kontaminasi saat proses identifikasi dan sekuen DNA dari spesies tersebut juga belum terdaftar dalam data GenBank.

Actions (login required)

View Item