GANDI, Abigail Samuelle (2024) Studi Penambatan Molekul Senyawa 4-kloro-6-(2-klorofenoksi)-2-fenilpirimidin sebagai Herbisida terhadap Asetil-KoA Karboksilase. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Download (54kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (572kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Download (112kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 15 January 2026. Download (119kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 15 January 2026. Download (288kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only until 15 January 2026. Download (50kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (472kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Download (38kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Download (243kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Abigail Samuelle Gandi-K1A020041-Skripsi-2024.pdf Restricted to Repository staff only Download (83kB)

Abstract

Pirimidin adalah senyawa aromatik yang turunannya memiliki aktivitas biologis sebagai pestisida, terutama pada herbisida. Enzim asetil-KoA karboksilase (ACCase) dapat menjadi target herbisida karena terdapatnya proses biosintesis asam lemak. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi molekuler senyawa 4-kloro-6-(2-klorofenoksi)-2-fenilpirimidin sebagai herbisida terhadap ACCase. Proses penambatan molekul dilakukan menggunakan InstaDock yang kemudian divisualisasikan hasilnya melalui BIOVIA Discovery Studio 3.5 Visualizer. Penelitian ini menggunakan diclofop sebagai ligan native dan senyawa 4-kloro-6-(2-klorofenoksi)-2-fenilpirimidin sebagai ligan uji. Hasil simulasi penambatan molekul menunjukkan nilai binding free energy, pKi, LE, dan torsional energy yang dimiliki ligan native berturut-turut, yaitu −9,4 kkal/mol; 6,89; 0,285 kkal/mol/non-H atom; dan 3,113 TEU. Sementara itu, nilai yang diperoleh pada ligan uji berturut-turut sebesar −7,3 kkal/mol; 6,09; 0,319 kkal/mol/non-H atom; dan 0,9339 TEU. Hasil visualisasi menunjukkan adanya interaksi molekuler dari ligan native dengan residu Leu-1705 dan Val-1967 yang memberikan aktivitas herbicide safeners yang baik bagi tanaman. Residu yang sama antara ligan uji dengan ligan native adalah Ile-1735, Val-2001, dan Ala-1627. Kesamaan tersebut menandakan bahwa ligan uji (senyawa 4-kloro-6-(2-klorofenoksi)-2-fenilpirimidin) memiliki potensi untuk diaplikasikan sebagai herbisida.

Actions (login required)

View Item