FADILAH, Dita Nur (2025) DNA barcoding tanaman silver velvet Borneo (Alocasia reginae L. Linden ex N.E.Br.) menggunakan sekuen trnL-F DAN ITS. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Download (208kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (526kB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Download (261kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 11 August 2026. Download (254kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 11 August 2026. Download (490kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 11 August 2026. Download (327kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Download (260kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Download (270kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Dita Nur Fadilah-A1D021048-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (613kB)

Abstract

Alocasia reginae L. Linden ex N.E.Br. (Silver Velvet Borneo) adalah salah satu spesies tanaman hias yang popular dari Araceae karena mempunyai nilai estetika tinggi sehingga cukup prospektif di bidang ekonomi. Seperti yang diketahui bahwa genetic database dari A. reginae di dalam NCBI masih terbatas. Oleh karena itu, diperlukan adanya teknik DNA barcoding untuk mengetahui karakteristik basa nukleotida suatu sekuen yang terkandung di dalam genom A. reginae. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan: (1) mengetahui karakteristik profil sekuen DNA region trnL-F dari A. reginae; dan (2) mengetahui posisi A. reginae dalam pohon filogenetik berdasarkan region trnL-F yang dibandingkan dengan database NCBI. Manfaat dari penelitian ini meliputi: (1) mampu berperan sebagai dasar rujukan dalam upaya pemuliaan tanaman A. reginae berdasarkan karakteristik sekuen trnL-F; (2) mampu berkontribusi secara langsung terhadap perkembangan sistem klasifikasi A. reginae melalui penggunaan sekuen trnL-F; dan (3) mampu meningkatkan pengetahuan dan keterampilan penulis terkait pengaplikasian bioinformatika khususnya DNA barcoding guna mendukung upaya konservasi genetik tumbuhan di Indonesia. Penelitian DNA barcoding terhadap Alocasia reginae melibatkan berbagai tahapan meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi DNA, elektroforesis dan visualisasi fragmen DNA, sekuensing, dan analisis data. Proses analisis data didukung oleh penggunaan laman GenBank NCBI, software MEGA 12, dan laman MultAlin. Output yang dihasilkan dari analisis data meliputi komposisi basa nukleotida, jarak genetik, dan pohon filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa profil sekuen trnL-F pada genom A. reginae mempunyai panjang sekuen contig 402 bp dan 406 bp dengan komposisi basa nukleotidanya meliputi T(U) (35,01%), C (17,88%), A (30,98%), dan G (16,12%). Sampel A. reginae dengan A. nebula dan A. melo memiliki nilai jarak genetik 0 mengindikasikan tidak terdapat adanya variasi nukleotida yang terdeteksi pada lokus trnL-F di antara ketiga spesies tersebut. Hal tersebut menunjukkan bahwa sekuen trnL-F memiliki keterbatasan resolusi dalam mendiskriminasi tumbuhan pada tingkatan taksa spesies.

Actions (login required)

View Item