HANAFI, Hanafi (2025) Analisis Keanekaragaman Komunitas Bakteri Sedimen Selat Makassar dan Laut Sawu menggunakan Metode Metagenomik Amplicon. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Download (580kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (4MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Download (2MB)
	PDF (BabI) BAB-I-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 11 August 2026. Download (5MB)
	PDF (BabII) BAB-II-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 11 August 2026. Download (18MB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 11 August 2026. Download (5MB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (20MB)
	PDF (BabV) BAB-V-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Download (936kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Download (12MB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Hanafi-L1C021032-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (25MB)

Abstract

Penelitian terkait eksplorasi komunitas bakteri pada suatu sampel lingkungan menjadi trend penelitian dalam beberapa dekade terakhir. Sedimen Selat Makassar dan Laut Sawu menjadi sampel lingkungan yang menarik untuk diteliti karena indikasi kontaminasi minyak memengaruhi komposisi taksonomi didalamnya. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui keanekaragaman komunitas bakteri di sedimen perairan tersebut. Metode metagenomik amplicon digunakan dalam penelitian ini dengan menggunakan sampel sedimen dari Selat Makassar (ST45) dan Laut Sawu (ST5). Ekstraksi e-DNA menggunakan kit komersial DNeasy PowerSoil Kit (Qiagen). Selanjutnya, sampel disekuensing di IOCAS (Institute of Oceanology, Chinese Academic of Science). Data hasil sequencing dianalisis menggunakan Rstudio. Hasil dari penelitian ini menunjukkan analisis alpha diversity menggunakan indeks Shannon, Simpson, dan Invsimpson menginterpretasikan tingkat keanekaragaman dan dominansi yang tinggi. Berdasarkan hasil analisis beta diversity menunjukkan bahwa jarak antar sampel terpaut jauh yang mengindikasikan perbedaan komposisi takson. Hasil analisis komposisi taksonomi menunjukkan sebanyak 49 filum, 84 kelas, 123 ordo, 224 famili, dan 442 genus berhasil diidentifikasi dengan Filum Proteobacteria yang sangat mendominansi hingga mewakili rata-rata kelimpahan relatif sebesar 47,36%. Kesimpulan dari penelitian ini menunjukkan indikasi pengaruh kontaminasi minyak terhadap komposisi taksonomi di ST5 dan ST45 sehingga bisa dijadikan informasi mengenai riset biodegradasi minyak.

Actions (login required)

View Item