MUFIDAH, Fatin Eri (2025) Profil Genomik dan Metabolomik Bakteri Galbibacter pasificus PAP.153 yang Bersimbiosis dengan Spons dari Perairan Taman Nasional Teluk Cendrawasih, Papua Barat. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.
![[img]](http://repository.unsoed.ac.id/style/images/fileicons/other.png) |
PDF (Cover)
COVER-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Download (128kB) |
|
PDF (Legalitas)
LEGALITAS-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB) |
|
PDF (Abstrak)
ABSTRAK-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Download (302kB) |
|
PDF (BabI)
BAB-I-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 13 August 2026. Download (293kB) |
|
PDF (BabII)
BAB-II-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 13 August 2026. Download (318kB) |
|
PDF (BabIII)
BAB-III-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only until 13 August 2026. Download (666kB) |
|
PDF (BabIV)
BAB-IV-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Restricted to Repository staff only Download (970kB) |
|
PDF (BabV)
BAB-V-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Download (257kB) |
|
PDF (DaftarPustaka)
DAFTAR PUSTAKA-Fatin Eri Mufidah-L1C021012-Skripsi-2025.pdf Download (341kB) |
|
PDF (Lampiran)
LAMPIRAN.pdf Restricted to Repository staff only Download (936kB) |
Abstract
Galbibacter pasificus PAP.153 merupakan bakteri simbion spons laut yang memiliki potensi dalam menghasilkan senyawa metabolit sekunder. Metabolit sekunder berperan penting dalam pengembangan ilmu bioteknologi, terutama dalam penemuan senyawa bioaktif baru. Dalam penemuan ini memerlukan adanya bantuan analisis genomik dan metabolomik guna mengidentifikasi Biosynthesis Gene Clusters (BGCs) yang berperan dalam sintesis senyawa metabolit sekunder. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis profil genomik dan metabolomik G. pasificus PAP.153 sebagai upaya eksplorasi senyawa bioaktif baru. Analisis genomik dilakukan menggunakan website antiSMASH 7.1.0 dan analisis metabolomik dilakukan dengan menganalisa supernatant, hasil ekstraksi aseton 5% dan metanol metabolit sekunder G. pasificus PAP.153 yang dikultur pada media LB dan NB. Analisis metabolomik dilakukan menggunakan metode LC-HRMS dan pendekatan molecular networking GNPS dan Cytoscape. Hasil analisis genomik menunjukkan adanya 4 klaster BGCs yang terdiri atas terpene, arylpolyene, dan resorcinol. Salah satu klaster menunjukkan kemiripan 75% dengan klaster flexirubin. Analisis metabolomik mendeteksi adanya 256 node dan 4 senyawa bioaktif terdereplikasi yaitu 1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine, PE-DAG 15:0 16:1, laxaphycin D, dan sarmentoside B. Supernatant menunjukkan node terbanyak dibandingkan ekstrak aseton 5% dan metanol yang mengindikasikan bahwa banyak senyawa bioaktif terdapat pada bagian ekstraselular. Flexirubin sebagai senyawa target dalam penelitian ini tidak teridentifikasi dalam hasil analisis metabolomik diduga karena kurangnya waktu inkubasi. Penelitian ini memperkuat potensi G. pasificus PAP.153 sebagai kandidat sumber senyawa bioaktif baru dari lingkungan laut dan penting untuk diteliti lebih lanjut.
| Item Type: | Thesis (Skripsi) |
|---|---|
| Nomor Inventaris: | L25120 |
| Uncontrolled Keywords: | BGCs; Galbibacter pasificus PAP.153; LC-HRMS; genomik; metabolit sekunder; metabolomik. |
| Subjects: | B > B8 Bacteria M > M60 Marine animals |
| Divisions: | Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan > S1 Ilmu Kelautan |
| Depositing User: | Mrs. Fatin Eri Mufidah |
| Date Deposited: | 13 Aug 2025 07:55 |
| Last Modified: | 13 Aug 2025 07:55 |
| URI: | http://repository.unsoed.ac.id/id/eprint/35832 |
Actions (login required)
 |
View Item |