ZAHRO, Fatimah Az (2018) Kekerabatan Streptomyces Spp. yang Bersifat Antibakteri Berdasarkan Gen Nonribosomal Peptide Synthetase. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Download (209kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (5MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Download (203kB)
	PDF (BabI) BAB I-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (125kB)
	PDF (BabII) BAB II-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (211kB)
	PDF (BabIII) BAB III-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (344kB)
	PDF (BabIV) BAB IV-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (461kB)
	PDF (BabV) BAB V-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (118kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR USTAKA-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Download (218kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-FATHIMAH AZ ZAHRO-B1J013085.pdf Restricted to Repository staff only Download (6MB)

Abstract

Bakteri Streptomyces spp. asal rhizosfer tanaman mangrove Bruguiera sp., Sonneratia sp., Rhizophora sp., Aegiceras corniculatum dan Avicennia marina telah berhasil diisolasi. Bakteri Streptomyces spp. tersebut terbukti menghasilkan aktivitas antibakteri yang mampu menghambat pertumbuhan Stapylococcus aureus dan Eschericia coli. Seleksi isolat potensial dilakukan berdasarkan pada tingginya kemampuan isolat dalam memproduksi aktivitas antibakteri. Sebanyak lima isolat potensial dianalisis lebih lanjut pada tahap molekuler dan kekerabatan spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi adanya gen Nonribosomal Peptide Synthetase (NRPS) pada bakteri Streptomyces spp. yang mampu menghambat pertumbuhan S. aureus dan E. coli, mengetahui karakteristik gen tersebut dan mengetahui hubungan kekerabatan isolat Streptomyces spp. berdasarkan gen penyandi NRPS. Deteksi gen NRPS dilakukan melalui tahapan isolasi DNA bakteri Streptomyces potensial, amplifikasi gen NRPS melalui teknik PCR, elektroforesis gel, sekuensing DNA, analisis sekuen DNA menggunakan software BioEdit, analisis prediksi produk metabolit sekunder menggunakan program AntiSmash dan analisis filogenetik menggunakan program MEGA. Hasil analisis menunjukkan 5 isolat yang diteliti terdeteksi memiliki gen NRPS, dengan ukuran nukleotida sekitar 700 bp. Sebanyak 3 isolat berhasil terkualifikasi untuk dianalisis sekuensing. Berdasarkan jarak genetik pada sekuen setiap isolat, isolat Streptomyces sp. E401, Streptomyces sp. E403, dan Streptomyces sp. E461 memiliki nilai kekerabatan yang cukup dekat karena memiliki nilai jarak genetik 0,4-0,6. Hasil analisis sekuen homolog dapat digunakan untuk prediksi metabolit sekunder Streptomyces spp. Secara umum, prediksi sekuen NRPS Streptomyces spp. memiliki homologi dengan beberapa klaster gen, meliputi Streptomycin biosynthetic gene cluster dan Syringomycin biosynthetic gene cluster. Prediksi metabolit sekunder yang dihasilkan menunjukkan Streptomisin dan Siringomisin.

Actions (login required)

View Item