Deteksi Cemaran Listeria monocytogenes Dalam Daging Ayam Mentah Dari Dua Pasar Tradisional Bogor: Studi Komparasi Metode qPCR dan Culture Based.

FARIZAL, Ahmad (2026) Deteksi Cemaran Listeria monocytogenes Dalam Daging Ayam Mentah Dari Dua Pasar Tradisional Bogor: Studi Komparasi Metode qPCR dan Culture Based. Skripsi thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

[img] PDF (Cover)
COVER-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf

Download (81kB)
[img] PDF (Legalitas)
LEGALITAS-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (391kB)
[img] PDF (Abstrak)
ABSTRAK-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf

Download (273kB)
[img] PDF (BabI)
BAB-I-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf
Restricted to Repository staff only until 13 May 2027.

Download (296kB)
[img] PDF (BabII)
BAB-II-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf
Restricted to Repository staff only until 13 May 2027.

Download (372kB)
[img] PDF (BabIII)
BAB-III-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf
Restricted to Repository staff only until 13 May 2027.

Download (464kB)
[img] PDF (BabIV)
BAB-IV-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (657kB)
[img] PDF (BabV)
BAB-V-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf

Download (295kB)
[img] PDF (DaftarPustaka)
DAFTAR PUSTAKA-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf

Download (288kB)
[img] PDF (Lampiran)
LAMPIRAN-Ahmad Farizal-B1A022040-Skripsi-2026.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (369kB)

Abstract

Daging ayam memiliki peran penting dalam memenuhi kebutuhan gizi manusia. Daging tidak hanya kaya akan protein, daging ayam juga kaya akan asam amino esensial yang seimbang. Kandungan air yang tinggi, nitrogen, mineral, dan pH ideal membuat daging ayam dapat menjadi medium pertumbuhan yang cocok bagi mikroorganisme karena. Listeria monocytogenes merupakan salah satu penyebab listeriosis yang beresiko tinggi bagi kelompok rentan. Kontaminasi silang, penerapan zona hygiene atau sanitasi yang lemah serta kelembaban yang tinggi, dilaporkan menjadi faktor utama dalam penyebaran L. monocytogenes. Metode deteksi patogen ini umumnya menggunakan metode kultur mikrobiologi, namun metode ini memerlukan waktu yang cukup lama. Metode alternatif berupa qPCR memiliki kemampuan deteksi yang cepat, sensitif, dan akurat. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi cemaran L. monocytogenes pada daging ayam mentah yang dipasarkan di wilayah Bogor serta membandingkan sensitivitas metode dalam deteksi L. monocytogenes dengan qPCR dan culture-based method dalam daging ayam mentah. Metode pengambilan sampel yang digunakan yakni metode purposive sampling. Sampel yang digunakan dalam pengujian sensitivitas metode deteksi diperoleh dari pasar swalayan di Kota Bogor sedangkan sampel surveillance berasal dari 10 titik berbeda di dua pasar tradisional Bogor. Penelitian studi komparasi sensitivitas metode dialawai dengan homogenisasi sampel dengan medium enrichment dan dilakukan inokulasi artifisial sebesar 0,1 mL suspensi yang mengandung <10 CFU/mL L. monocytogenes. Enrichment dilakukan dengan waktu 2, 7, dan 12 jam dengan 5 kali pengulangan dan 1 kontrol negatif. Masing masing waktu enrichment dianalisis dengan metode qPCR dan culture-based. Variabel bebas meliputi lama waktu enrichment dan metode deteksi. Variabel terikat berupa hasil positif deteksi. Parameter yang diamati yakni nilai Ct pada metode qPCR dan pertumbuhan koloni pada culture-based. Data dianalisis dengan analisis Cohen Kappa yang merupakan ukuran statistik untuk mengevaluasi hasil antara dua metode atau instrumen pengukuran. Hasil penelitian menunjukkan bahwa waktu enrichment minimum untuk mendeteksi L. monocytogenes adalah 12 jam dengan metode yang paling sensitif adalah qPCR. Selama periode waktu enrichment ini seluruh sampel menunjukkan hasil positif yang ditandai dengan kenaikan kurva amplifikasi dibawah <40 siklus. Analisis kesesuaian metode menggunakan uji Cohen Kappa menghasilkan nilai k yang tidak dapat dihitung sehingga interpretasi didasarkan pada observed agreemnet yang berilai 1. Secara statistik nilai tersebut menunjukkan kesepakatan sempurna (Perfect agreement). Nilai tersebut mengindikasikan bahwa kedua metode dapat saling menggantikan dalam deteksi L. monocytogenes sesuai dengan kebutuhan analisis. Penerapan kedua metode terhadap sampel daging ayam yang diperoleh dari 10 titik berbeda di dua pasar tradisional di wilayah Bogor menunjukkan bahwa sampel daging ayam tidak terdapat cemaran L. monocytogenes.

Item Type: Thesis (Skripsi)
Nomor Inventaris: B26024
Uncontrolled Keywords: deteksi, komparasi, kultur, L. monocytogenes, qPCR.
Subjects: F > F252 Food contamination
M > M148 Meat
M > M321 Microorganisms
Divisions: Fakultas Biologi > S1 Biologi
Depositing User: Mr Ahmad Farizal
Date Deposited: 13 May 2026 02:53
Last Modified: 13 May 2026 02:53
URI: http://repository.unsoed.ac.id:443/id/eprint/41207

Actions (login required)

View Item View Item