FAIZAH, Arina Umi (2023) Keragaman Morfometrik, Polimorfisme Gen MC4R dan Asosiasinya dengan Bobot Badan dan Panjang Shank Ayam Lokal. Masters thesis, Universitas Jenderal Soedirman.

	PDF (Cover) COVER-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Download (227kB)
	PDF (Legalitas) LEGALITAS-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)
	PDF (Abstrak) ABSTRAK-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Download (268kB)
	PDF (BabI) BAB-I-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only until 26 May 2024. Download (244kB)
	PDF (BabII) BAB-II-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only until 26 May 2024. Download (272kB)
	PDF (BabIII) BAB-III-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only until 26 May 2024. Download (237kB)
	PDF (BabIV) BAB-IV-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (327kB)
	PDF (BabV) BAB-V-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (479kB)
	PDF (BabVI) BAB-VI-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Download (225kB)
	PDF (DaftarPustaka) DAFTAR PUSTAKA-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Download (319kB)
	PDF (Lampiran) LAMPIRAN-Arina Umi Faizah-D2A021014-TESIS-2023.pdf Restricted to Repository staff only Download (374kB)

Abstract

Gen yang berpengaruh terhadap sifat pertumbuhan ternak yang bernilai ekonomis adalah gen Melanocortin-4 Reseptor (MC4R). Gen MC4R merupakan gen yang bertugas untuk mengatur asupan makanan dan keseimbangan energi dan bobot badan. Keragaman genetik dapat digunakan sebagai dasar untuk memperbaiki mutu genetik melalui seleksi atau persilangan pada ternak. Materi yang digunakan sebanyak 98 ekor terdiri dari ayam Kedu Merah dan ayam Kampung umur 37 minggu, masing-masing 9 ekor ayam jantan dan 40 ekor ayam betina. Penelitian dilakukan menggunakan metode eksperimen, ayam diidentifikasi secara kualitatif dan kuantitatif serta dilakukan pengambilan sampel darah yang kemudian diisolasi DNA, Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan sepasang primer MC4R dengan primer forward 5’-GAA TTT CAC CCA GCA TCG-3’ dan primer reverse 5’-GAG GTT CTT GTT TTG GCT AT-3’, Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP), dan sequencing. Variabel morfometrik yang diukur meliputi data kualitatif dan data kuantitatif. Metode analisis menggunakan analisis uji t untuk mengetahui perbedaan karakteristik pada ayam Kedu Merah dan Kampung. Keragaman genetik dihitung menggunakan nilai heterozigositas, frekuensi gen, frekuensi genotipe dan frekuensi alel. Asosiasi antara gen MC4R dengan bobot badan dan panjang shank menggunakan analisis korelasi. Hasil pada morfometrik ditunjukkan bahwa ayam lokal jantan dan betina pada bobot badan, panjang paruh, panjang pial, lebar dada, lingkar dada, panjang femur, panjang shank, dan panjang jari ketiga memiliki perbedaan yang signifikan (P<0,05). Berdasarkan hasil PCR-SSCP bahwa gen MC4R bersifat polimorfik, pada ayam Kedu Merah diperoleh 2 genotipe yaitu GG dan GC dengan nilai frekuensi genotipe masing-masing sebesar 0,51 dan 0,49, sedangkan pada ayam Kampung diperoleh 3 genotipe yaitu GG, GC dan CC dengan nilai frekuensi genotipe masing-masing sebesar 0,32, 0,50, dan 0,18. Nilai frekuensi gen pada alel G dan C pada ayam Kedu Merah sebesar 0,74 dan 0,26 sedangkan ayam Kampung sebesar 0,66 dan 0,34. Heterozigositas pada ayam Kedu Merah dan Kampung memiliki nilai masing-masing sebesar 0,38 dan 0,45. Jarak genetik pada ayam Kedu dan Kampung memiliki kekerabatan yang dekat 0,42 dibandingkan ayam Hutan Merah dengan Kedu Merah 0,71. Hasil korelasi antara gen MC4R dengan bobot badan dan panjang shank ayam Kedu Merah dan Kampung memiliki asosiasi yang relatif rendah.

Actions (login required)

View Item